36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1053 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  100 
 
 
410 aa  842    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  36.6 
 
 
410 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  34.49 
 
 
532 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  31.17 
 
 
507 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  31.17 
 
 
507 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  29.64 
 
 
400 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  31.55 
 
 
418 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  31.28 
 
 
418 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  28.79 
 
 
384 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  33.61 
 
 
251 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  28.02 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2332  transposase  33.93 
 
 
124 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.758466  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  27.32 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  27.32 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  31.11 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  26.44 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  26.32 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  22.44 
 
 
327 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  26.52 
 
 
375 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  32.38 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  35 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  35 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  35 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  35 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  35 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  28.71 
 
 
272 aa  43.5  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  29.47 
 
 
492 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>