14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2588 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 400 aa  833    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  33.92 
 
 		 507 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  33.92 
 
 		 507 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  34.26 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  31.42 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  31.42 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  32.21 
 
 		 384 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  29.64 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  36.27 
 
 		 197 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  32.04 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  29.66 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  27.17 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2332  transposase  27.62 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.758466  normal  0.484196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>