15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12821 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  50.94 
 
 		 418 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  50.67 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  39.61 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  32.21 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  33.8 
 
 		 507 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  33.8 
 
 		 507 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  46.19 
 
 		 197 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12819  hypothetical protein  78.22 
 
 		 143 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  31.77 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  28.79 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13148  hypothetical protein  47.96 
 
 		 116 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  34.51 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  26.64 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>