22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2527 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  74.77 
 
 		 432 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  100 
 
 		 407 aa  837    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  50.4 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3358  integrase, catalytic region  94.44 
 
 		 90 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3930  hypothetical protein  75 
 
 		 71 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  28.02 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  38.67 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  27.73 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  27.11 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  31.03 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  27.17 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  28.48 
 
 		 507 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  28.48 
 
 		 507 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  29.58 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7347  hypothetical protein  46.94 
 
 		 73 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.246905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  30.3 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  30.3 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  26.64 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>