31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7430 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  100 
 
 		 532 aa  1090    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  50.51 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  50.51 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  33.84 
 
 		 400 aa  240  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  34.44 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  34.49 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  32.82 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  32.56 
 
 		 418 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  31.77 
 
 		 384 aa  161  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2332  transposase  50 
 
 		 124 aa  105  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.758466  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  31.16 
 
 		 197 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  32.45 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  50.85 
 
 		 482 aa  67  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  50.85 
 
 		 482 aa  67  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.693279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  34.51 
 
 		 488 aa  55.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  44.26 
 
 		 497 aa  53.9  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  27.73 
 
 		 407 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  33.98 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  33.98 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  33.98 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  33.98 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  33.98 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  26.2 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  35 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  35 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  35 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  26.2 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  26.2 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 505 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>