47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3038 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 432 aa  890    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  74.77 
 
 		 407 aa  646    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  60.32 
 
 		 251 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3358  integrase, catalytic region  70 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3930  hypothetical protein  67.21 
 
 		 71 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  29.67 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  36.75 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  32.45 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  32.73 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  32.73 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  27.63 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  27.63 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  32.04 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  34.64 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7347  hypothetical protein  53.06 
 
 		 73 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.246905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  32.69 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  27.64 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  27.39 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  27.39 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  27.39 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2069  integrase catalytic region  39.02 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  28.46 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  28.46 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 		 338 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 		 338 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 		 338 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  28.46 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  24.19 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>