20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0891 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  99.04 
 
 		 418 aa  850    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  100 
 
 		 418 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12821  hypothetical protein  50.67 
 
 		 384 aa  339  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13149  hypothetical protein  74.49 
 
 		 197 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.933816 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  31.42 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 		 410 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  33.57 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  33.57 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  32.82 
 
 		 532 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13148  hypothetical protein  66.09 
 
 		 116 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  31.28 
 
 		 410 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3038  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2332  transposase  35.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.758466  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1649  hypothetical protein  29.66 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.502661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12819  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2527  integrase, catalytic region  31.03 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  31.25 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  32.18 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  28.4 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  32.18 
 
 		 338 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>