9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2332 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2332  transposase  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.758466  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7430  integrase catalytic region  50 
 
 		 532 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.794856 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5048  integrase catalytic region  47.46 
 
 		 507 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6000  integrase catalytic region  47.46 
 
 		 507 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2415  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 		 410 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0189453  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0891  Integrase catalytic region  35.78 
 
 		 418 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1886  Integrase catalytic region  35.78 
 
 		 418 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0003225  normal  0.0562744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1053  Integrase catalytic region  33.93 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2588  integrase domain-containing protein  27.62 
 
 		 400 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.288598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>