334 genes were found for organism Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mesil_3198    NC_014213  413  408      decreased coverage  0.0000000325325  unclonable  0.00000335198  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3199  CDS  NC_014213  416  856  441  hypothetical protein  YP_003686529  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3200  CDS  NC_014213  853  1707  855  translation initiation factor IF-2  YP_003686530  hitchhiker  0.0000121802  unclonable  0.00000453571  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3201  CDS  NC_014213  1718  3013  1296  hypothetical protein  YP_003686531  hitchhiker  0.000763805  unclonable  0.00000506587  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3202  CDS  NC_014213  3023  4309  1287  LigA protein  YP_003686532  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3203  CDS  NC_014213  4302  4850  549  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  YP_003686533  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3204  CDS  NC_014213  4859  5527  669  autotransporter-associated beta strand repeat protein  YP_003686534  normal  hitchhiker  0.0000564302  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3205  CDS  NC_014213  5594  7282  1689  hypothetical protein  YP_003686535  normal  hitchhiker  0.0000812064  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3206  CDS  NC_014213  7319  8533  1215  hypothetical protein  YP_003686536  normal  hitchhiker  0.00007469  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3207  CDS  NC_014213  8597  9904  1308  hypothetical protein  YP_003686537  normal  hitchhiker  0.0000789667  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3208  CDS  NC_014213  10035  11261  1227  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_003686538  normal  hitchhiker  0.000066146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3209  CDS  NC_014213  11404  12165  762  hypothetical protein  YP_003686539  normal  hitchhiker  0.0000637272  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3210  CDS  NC_014213  12176  13423  1248  hypothetical protein  YP_003686540  normal  hitchhiker  0.00223116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3211  CDS  NC_014213  13689  14027  339  hypothetical protein  YP_003686541  normal  hitchhiker  0.00147206  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3212    NC_014213  14040  15079  1040      normal  0.711515  normal  0.0186572  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3213  CDS  NC_014213  15188  16996  1809  hypothetical protein  YP_003686542  normal  0.268821  normal  0.022528  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3214  CDS  NC_014213  16993  17850  858  hypothetical protein  YP_003686543  normal  0.97087  normal  0.0411002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3215  CDS  NC_014213  17892  18473  582  hypothetical protein  YP_003686544  normal  normal  0.0373612  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3216  CDS  NC_014213  18475  19926  1452  Hydrogenase 4 membrane component (E)  YP_003686545  normal  0.492531  normal  0.0423716  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3217  CDS  NC_014213  19953  21494  1542  hypothetical protein  YP_003686546  normal  0.728125  normal  0.0835857  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3218  CDS  NC_014213  21491  22363  873  hypothetical protein  YP_003686547  normal  0.325028  normal  0.252924  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3219  CDS  NC_014213  22397  22789  393  LigA protein  YP_003686548  normal  0.244717  normal  0.586518  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3220  CDS  NC_014213  22786  23049  264  hypothetical protein  YP_003686549  normal  0.317809  normal  0.588412  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3221  CDS  NC_014213  23054  23398  345  hypothetical protein  YP_003686550  normal  0.466762  normal  0.59754  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3222  CDS  NC_014213  23887  24291  405  hypothetical protein  YP_003686551  normal  0.333438  normal  0.638176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3223    NC_014213  24327  24515  189      normal  0.259008  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3224    NC_014213  25397  25756  360      normal  0.179822  normal  0.962511  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3225  CDS  NC_014213  26069  27076  1008  hypothetical protein  YP_003686552  normal  0.118806  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3226  CDS  NC_014213  27138  28370  1233  Transcriptional regulator  YP_003686553  normal  0.101031  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3227  CDS  NC_014213  28387  29310  924  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003686554  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3228  CDS  NC_014213  29303  30121  819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003686555  decreased coverage  0.00685083  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3229    NC_014213  30125  31572  1448      normal  0.210758  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3230  CDS  NC_014213  31824  32435  612  hypothetical protein  YP_003686556  normal  0.17036  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3231  CDS  NC_014213  32395  32757  363  hypothetical protein  YP_003686557  normal  0.127576  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3232  CDS  NC_014213  32754  33725  972  hypothetical protein  YP_003686558  normal  0.259813  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3233  CDS  NC_014213  33734  35812  2079  hypothetical protein  YP_003686559  normal  0.546818  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3234  CDS  NC_014213  35799  36164  366  Ribonucleotide reductase large subunit domain protein  YP_003686560  normal  0.177065  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3235  CDS  NC_014213  36589  37620  1032  hypothetical protein  YP_003686561  normal  0.0294411  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3236  CDS  NC_014213  37765  39036  1272  hypothetical protein  YP_003686562  normal  0.0104131  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3237  CDS  NC_014213  39079  40202  1124  hypothetical protein  YP_003686563  normal  0.0336824  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3238    NC_014213  40266  40631  366      normal  0.0504424  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3239  CDS  NC_014213  40628  41419  792  hypothetical protein  YP_003686564  normal  0.137179  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3240  CDS  NC_014213  41421  42347  927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003686565  normal  0.367926  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3241  CDS  NC_014213  42328  42972  645  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_003686566  normal  0.347977  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3242    NC_014213  43357  44632  1276      normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3243  CDS  NC_014213  44665  45525  861  hypothetical protein  YP_003686567  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3244  CDS  NC_014213  45657  45794  138  hypothetical protein  YP_003686568  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3245  CDS  NC_014213  45791  46054  264  hypothetical protein  YP_003686569  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3246  CDS  NC_014213  46155  46553  399  hypothetical protein  YP_003686570  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3247  CDS  NC_014213  46550  47050  501  hypothetical protein  YP_003686571  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3248  CDS  NC_014213  47205  47435  231  hypothetical protein  YP_003686572  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3249  CDS  NC_014213  47490  48224  735  hypothetical protein  YP_003686573  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3250  CDS  NC_014213  48249  49199  951  hypothetical protein  YP_003686574  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3251  CDS  NC_014213  49180  49854  675  ketose-bisphosphate aldolase class-II  YP_003686575  normal  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3252  CDS  NC_014213  49847  50815  969  ribulose-phosphate 3-epimerase  YP_003686576  normal  0.570797  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3253  CDS  NC_014213  50805  51743  939  phosphoribulokinase/uridine kinase  YP_003686577  normal  0.346779  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3254  CDS  NC_014213  51753  52175  423  hypothetical protein  YP_003686578  normal  0.792677  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3255  CDS  NC_014213  52186  53628  1443  Ribulose-bisphosphate carboxylase  YP_003686579  normal  0.936346  normal  0.393847  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3256  CDS  NC_014213  53638  54627  990  hypothetical protein  YP_003686580  normal  0.552771  normal  0.220961  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3257  CDS  NC_014213  54718  55611  894  translation initiation factor IF-2  YP_003686581  normal  normal  0.22333  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3258  CDS  NC_014213  55608  56087  480  general secretory system II protein E domain protein  YP_003686582  normal  normal  0.21153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3259  CDS  NC_014213  56098  56376  279  hypothetical protein  YP_003686583  normal  normal  0.347342  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3260  CDS  NC_014213  56384  56671  288  annexin VII  YP_003686584  normal  normal  0.335369  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3261  CDS  NC_014213  56668  56964  297  hypothetical protein  YP_003686585  normal  normal  0.332933  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3262  CDS  NC_014213  56961  57713  753  hypothetical protein  YP_003686586  normal  normal  0.343145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3263  CDS  NC_014213  57710  59701  1992  hypothetical protein  YP_003686587  normal  normal  0.415108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3264  CDS  NC_014213  59818  61182  1365  hypothetical protein  YP_003686588  normal  normal  0.214732  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3265  CDS  NC_014213  61271  62302  1032  hypothetical protein  YP_003686589  normal  normal  0.208584  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3266    NC_014213  62442  62600  159      normal  normal  0.179414  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3267  CDS  NC_014213  62570  62827  258  hypothetical protein  YP_003686590  normal  normal  0.181881  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3268  CDS  NC_014213  62878  63297  420  hypothetical protein  YP_003686591  normal  normal  0.190348  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3269  CDS  NC_014213  63294  63515  222  hypothetical protein  YP_003686592  normal  normal  0.0537431  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3270  CDS  NC_014213  63692  63997  306  hypothetical protein  YP_003686593  normal  0.311511  normal  0.0573367  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3271    NC_014213  63994  64239  246      normal  0.206111  normal  0.0560928  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3272  CDS  NC_014213  64318  64737  420  hypothetical protein  YP_003686594  normal  0.250729  normal  0.0598627  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3273  CDS  NC_014213  64766  64942  177  hypothetical protein  YP_003686595  normal  0.182658  normal  0.0564057  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3274  CDS  NC_014213  65633  66196  564  hypothetical protein  YP_003686596  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3275  CDS  NC_014213  66264  67387  1124  transcriptional regulator, GntR family  YP_003686597  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3276  CDS  NC_014213  67532  68734  1203  hypothetical protein  YP_003686598  decreased coverage  0.000379613  normal  0.0373612  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3277  CDS  NC_014213  68716  69501  786  translation initiation factor IF-2  YP_003686599  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3278  CDS  NC_014213  69488  70261  774  ABC transporter related protein  YP_003686600  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3279  CDS  NC_014213  70258  71256  999  hypothetical protein  YP_003686601  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3280  CDS  NC_014213  71256  72074  819  SL44-1; basic proline-rich protein  YP_003686602  hitchhiker  0.0087795  normal  0.0783046  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3281  CDS  NC_014213  72598  72750  153  hypothetical protein  YP_003686603  normal  0.0114692  normal  0.0725563  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3282  CDS  NC_014213  73572  74015  444  hypothetical protein  YP_003686604  normal  0.0656085  normal  0.0348578  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3283  CDS  NC_014213  74012  74263  252  hypothetical protein  YP_003686605  normal  0.0854112  normal  0.0138905  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3284  CDS  NC_014213  74338  75423  1086  hypothetical protein  YP_003686606  normal  0.693804  decreased coverage  0.00631019  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3285  CDS  NC_014213  75775  76905  1131  hypothetical protein  YP_003686607  normal  normal  0.0165646  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3286  CDS  NC_014213  76914  78239  1326  hypothetical protein  YP_003686608  normal  normal  0.0169038  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3287  CDS  NC_014213  78262  79092  831  glutamine synthetase catalytic region  YP_003686609  normal  normal  0.0150426  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3288  CDS  NC_014213  79089  79544  456  precursor of collagen, alpha 2(V)  YP_003686610  normal  normal  0.0142731  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3289  CDS  NC_014213  79622  80653  1032  hypothetical protein  YP_003686611  normal  normal  0.0160214  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3290  CDS  NC_014213  80854  81612  759  hypothetical protein  YP_003686612  normal  normal  0.0159101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3291  CDS  NC_014213  81609  82322  714  hypothetical protein  YP_003686613  normal  normal  0.0150426  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3292  CDS  NC_014213  82350  83255  906  hypothetical protein  YP_003686614  normal  hitchhiker  0.00518243  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3293  CDS  NC_014213  83273  84292  1020  hypothetical protein  YP_003686615  normal  normal  0.015254  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3294  CDS  NC_014213  84289  85440  1152  hypothetical protein  YP_003686616  normal  0.953272  normal  0.0380984  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3295  CDS  NC_014213  85505  86254  750  Extracellular ligand-binding receptor  YP_003686617  normal  normal  0.0741916  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3296  CDS  NC_014213  86417  87976  1560  hypothetical protein  YP_003686618  normal  normal  0.171098  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3297  CDS  NC_014213  87991  89472  1482  hypothetical protein  YP_003686619  normal  normal  0.0920316  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>