14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3229 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3229    100 
 
 		 1448 bp  2870    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.210758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  99.72 
 
 		 1446 bp  2809    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  89.16 
 
 		 1419 bp  93.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  94 
 
 		 1731 bp  75.8  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  92.31 
 
 		 1461 bp  71.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  97.22 
 
 		 1020 bp  63.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  97.06 
 
 		 2565 bp  60  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  94.44 
 
 		 1821 bp  56  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  94.44 
 
 		 1704 bp  56  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  96.67 
 
 		 3267 bp  52  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  96.43 
 
 		 1806 bp  48.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  91.67 
 
 		 3267 bp  48.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  93.75 
 
 		 1455 bp  48.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  96.43 
 
 		 1848 bp  48.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>