More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3213 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3434  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1125    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1125    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.268821  normal  0.022528 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.37 
 
 		 662 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  32.31 
 
 		 662 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  32.46 
 
 		 669 aa  203  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  33.09 
 
 		 683 aa  203  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 		 577 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  31.82 
 
 		 674 aa  200  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  29.31 
 
 		 644 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  29.14 
 
 		 644 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  29.98 
 
 		 617 aa  195  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.93 
 
 		 659 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  30 
 
 		 643 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.29 
 
 		 659 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.76 
 
 		 688 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 		 666 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  32.14 
 
 		 649 aa  194  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 		 646 aa  193  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 		 667 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.07 
 
 		 661 aa  190  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  30.88 
 
 		 669 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.07 
 
 		 672 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.77 
 
 		 672 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 672 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  29.25 
 
 		 672 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.79 
 
 		 660 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  29.72 
 
 		 672 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.1 
 
 		 672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  35.47 
 
 		 660 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  35.47 
 
 		 660 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.62 
 
 		 669 aa  184  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  31.83 
 
 		 674 aa  184  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  29.73 
 
 		 669 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  31.55 
 
 		 673 aa  183  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  31.02 
 
 		 672 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.6 
 
 		 668 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  32.87 
 
 		 673 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  30.05 
 
 		 674 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  29.85 
 
 		 669 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  35.36 
 
 		 654 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  30.73 
 
 		 748 aa  177  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  30.02 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  36.1 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  34.94 
 
 		 679 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  31.7 
 
 		 671 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  31.07 
 
 		 687 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  29.97 
 
 		 669 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  42.35 
 
 		 666 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  43.6 
 
 		 665 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  33.04 
 
 		 671 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  28.33 
 
 		 633 aa  164  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  38.61 
 
 		 654 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  27.57 
 
 		 650 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  27.18 
 
 		 655 aa  162  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.52 
 
 		 666 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  32.06 
 
 		 665 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  29.85 
 
 		 668 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  31.45 
 
 		 681 aa  161  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  29.85 
 
 		 668 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  28.35 
 
 		 669 aa  160  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 		 723 aa  160  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  26.93 
 
 		 655 aa  160  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.52 
 
 		 661 aa  160  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.21 
 
 		 666 aa  160  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.86 
 
 		 674 aa  158  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  29.62 
 
 		 674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  39.14 
 
 		 654 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  41.9 
 
 		 666 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  35.12 
 
 		 654 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.02 
 
 		 646 aa  151  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  34.2 
 
 		 737 aa  144  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  33.48 
 
 		 664 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  33.19 
 
 		 663 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  29.05 
 
 		 671 aa  138  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  35.86 
 
 		 948 aa  137  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  29.06 
 
 		 672 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  29.61 
 
 		 672 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.67 
 
 		 959 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.81 
 
 		 801 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.81 
 
 		 801 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.97 
 
 		 801 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.68 
 
 		 662 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.79 
 
 		 790 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.6 
 
 		 953 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 		 633 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 		 633 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.23 
 
 		 500 aa  117  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.55 
 
 		 967 aa  117  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0726  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.69 
 
 		 684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0242608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.85 
 
 		 628 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  34.35 
 
 		 682 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.79 
 
 		 953 aa  114  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.67 
 
 		 946 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 		 792 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.11 
 
 		 997 aa  111  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 		 670 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0748  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  33.33 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.91 
 
 		 970 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 		 585 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>