3784 genes were found for organism Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cfla_0001  CDS  NC_014151  68  1672  +  1605  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003635120  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0002  CDS  NC_014151  2426  3556  +  1131  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003635121  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0003  CDS  NC_014151  3658  4587  +  930  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  YP_003635122  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0004  CDS  NC_014151  4593  5789  +  1197  DNA replication and repair protein RecF  YP_003635123  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0005  CDS  NC_014151  5779  6402  +  624  protein of unknown function DUF721  YP_003635124  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0006  CDS  NC_014151  6613  8709  +  2097  DNA gyrase, B subunit  YP_003635125  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0007  CDS  NC_014151  8776  11388  +  2613  DNA gyrase, A subunit  YP_003635126  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0008  CDS  NC_014151  11385  12302  +  918  hypothetical protein  YP_003635127  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0009  CDS  NC_014151  12577  12696  +  120  hypothetical protein  YP_003635128  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0010  CDS  NC_014151  12978  13370  +  393  hypothetical protein  YP_003635129  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0011  CDS  NC_014151  13374  14390  +  1017  Radical SAM domain protein  YP_003635130  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0012  CDS  NC_014151  14510  15739  +  1230  protein of unknown function UPF0027  YP_003635131  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0013  CDS  NC_014151  16323  16526  +  204  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_003635132  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0014  CDS  NC_014151  16699  17259  -  561  hypothetical protein  YP_003635133  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0015  CDS  NC_014151  17312  18001  -  690  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003635134  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0016  CDS  NC_014151  18226  21198  -  2973  glycoside hydrolase family 9  YP_003635135  normal  0.114686  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0017  CDS  NC_014151  21419  22330  -  912  hypothetical protein  YP_003635136  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0018  CDS  NC_014151  22512  23051  +  540  Peptidylprolyl isomerase  YP_003635137  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0019  CDS  NC_014151  23227  23943  +  717  Rhomboid family protein  YP_003635138  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0020  CDS  NC_014151  24148  24399  -  252  protein of unknown function UPF0233  YP_003635139  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0021  CDS  NC_014151  24594  25436  +  843  protein of unknown function DUF881  YP_003635140  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0022  CDS  NC_014151  25433  26239  +  807  sortase family protein  YP_003635141  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0023  CDS  NC_014151  26286  26447  +  162  hypothetical protein  YP_003635142  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0024  CDS  NC_014151  26444  27067  +  624  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003635143  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0025  CDS  NC_014151  27151  29157  -  2007  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_003635144  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0026  CDS  NC_014151  29157  30491  -  1335  serine/threonine protein kinase  YP_003635145  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0027  CDS  NC_014151  30488  31939  -  1452  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003635146  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0028  CDS  NC_014151  31936  33537  -  1602  cell cycle protein  YP_003635147  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0029  CDS  NC_014151  33537  34976  -  1440  protein serine/threonine phosphatase  YP_003635148  normal  0.893327  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0030  CDS  NC_014151  34981  35490  -  510  FHA domain containing protein  YP_003635149  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0031  CDS  NC_014151  35500  36207  -  708  FHA domain containing protein  YP_003635150  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0032  CDS  NC_014151  36945  38582  -  1638  hypothetical protein  YP_003635151  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0033  CDS  NC_014151  38579  39544  -  966  hypothetical protein  YP_003635152  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0034  CDS  NC_014151  39670  39903  -  234  putative MscS mechanosensitive ion channel  YP_003635153  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0035  CDS  NC_014151  41751  44126  +  2376  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  YP_003635154  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0036  CDS  NC_014151  44619  45458  +  840  hypothetical protein  YP_003635155  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0037  CDS  NC_014151  46673  47677  -  1005  protein of unknown function DUF955  YP_003635156  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0038  CDS  NC_014151  47736  48374  +  639  hypothetical protein  YP_003635157  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0039  CDS  NC_014151  49372  51864  +  2493  hypothetical protein  YP_003635158  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0040  CDS  NC_014151  51861  52253  +  393  hypothetical protein  YP_003635159  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0041  CDS  NC_014151  52258  52791  -  534  hypothetical protein  YP_003635160  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0042  CDS  NC_014151  52788  52901  -  114  hypothetical protein  YP_003635161  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0043  CDS  NC_014151  53013  53888  -  876  sortase family protein  YP_003635162  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0044  CDS  NC_014151  53998  55521  -  1524  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  YP_003635163  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0045  CDS  NC_014151  55629  60035  -  4407  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  YP_003635164  normal  0.292772  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0046  CDS  NC_014151  60180  61100  +  921  ABC transporter related protein  YP_003635165  normal  0.0867607  normal  0.238572  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0047  CDS  NC_014151  61324  62115  +  792  CHAP domain containing protein  YP_003635166  normal  0.117415  normal  0.141274  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0048  CDS  NC_014151  62200  62811  +  612  hypothetical protein  YP_003635167  normal  0.0569096  normal  0.141883  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0049  CDS  NC_014151  62865  63566  +  702  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003635168  normal  0.0384611  normal  0.0476146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0050  CDS  NC_014151  63563  65782  +  2220  putative signal transduction histidine kinase  YP_003635169  normal  0.300283  normal  0.0383844  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0051  CDS  NC_014151  65893  66366  +  474  YiaAB two helix domain protein  YP_003635170  normal  1  normal  0.0250987  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0052  CDS  NC_014151  66394  67374  -  981  transcriptional regulator, LacI family  YP_003635171  normal  1  normal  0.0148235  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0053  CDS  NC_014151  67515  69161  +  1647  ABC transporter related protein  YP_003635172  normal  1  decreased coverage  0.00894848  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0054  CDS  NC_014151  69174  69794  -  621  protein of unknown function UPF0029  YP_003635173  normal  1  decreased coverage  0.00609862  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0055  CDS  NC_014151  69918  70463  +  546  hypothetical protein  YP_003635174  normal  1  decreased coverage  0.00566236  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0056  CDS  NC_014151  70589  71578  +  990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_003635175  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0057  CDS  NC_014151  71702  73168  +  1467  hypothetical protein  YP_003635176  normal  0.175818  hitchhiker  0.00826975  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0058  CDS  NC_014151  73217  73615  -  399  sec-C motif domain protein  YP_003635177  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0059  CDS  NC_014151  73691  74359  +  669  hypothetical protein  YP_003635178  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0060  CDS  NC_014151  74287  75780  -  1494  hypothetical protein  YP_003635179  normal  0.389745  decreased coverage  0.00689625  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0061  CDS  NC_014151  75821  77266  -  1446  hypothetical protein  YP_003635180  normal  0.0810165  decreased coverage  0.00684623  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0062  CDS  NC_014151  77306  78775  -  1470  hypothetical protein  YP_003635181  normal  0.78779  decreased coverage  0.00675708  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0063  CDS  NC_014151  78826  80310  -  1485  hypothetical protein  YP_003635182  normal  0.540615  decreased coverage  0.00684623  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0064  CDS  NC_014151  80380  81807  -  1428  hypothetical protein  YP_003635183  normal  1  decreased coverage  0.0067105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0065  CDS  NC_014151  81858  83351  -  1494  hypothetical protein  YP_003635184  normal  1  decreased coverage  0.0062179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0066  CDS  NC_014151  83400  84941  -  1542  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_003635185  normal  0.977022  decreased coverage  0.00703052  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0067  CDS  NC_014151  85007  86182  -  1176  extracellular repeat protein, HAF family  YP_003635186  normal  0.899594  normal  0.0302964  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0068  CDS  NC_014151  86232  87386  -  1155  extracellular repeat protein, HAF family  YP_003635187  normal  1  decreased coverage  0.00675708  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0069  CDS  NC_014151  87725  88771  +  1047  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  YP_003635188  normal  1  decreased coverage  0.00693904  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0070  CDS  NC_014151  89068  89676  -  609  transcriptional regulator, TetR family  YP_003635189  normal  1  decreased coverage  0.00707412  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0071  CDS  NC_014151  89779  90471  +  693  putative acetyltransferase  YP_003635190  normal  1  normal  0.0359918  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0072  CDS  NC_014151  90478  91944  -  1467  transcriptional regulator, XRE family  YP_003635191  normal  1  normal  0.0809805  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0073  CDS  NC_014151  92499  93857  +  1359  isocitrate lyase  YP_003635192  normal  1  normal  0.136709  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0074  CDS  NC_014151  94005  95672  +  1668  malate synthase A  YP_003635193  normal  1  normal  0.481582  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0075  CDS  NC_014151  96234  96998  +  765  methionine aminopeptidase, type I  YP_003635194  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0076  CDS  NC_014151  97104  98837  -  1734  DNA-directed DNA polymerase  YP_003635195  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0077  CDS  NC_014151  99000  100007  -  1008  hypothetical protein  YP_003635196  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0078  CDS  NC_014151  100137  100673  +  537  protein tyrosine phosphatase  YP_003635197  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0079  CDS  NC_014151  100796  102370  +  1575  Methyltransferase type 12  YP_003635198  normal  0.995415  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0080  CDS  NC_014151  102611  103786  +  1176  aminotransferase class I and II  YP_003635199  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0081  CDS  NC_014151  103803  105173  -  1371  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  YP_003635200  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0082  CDS  NC_014151  105290  105655  -  366  hypothetical protein  YP_003635201  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0083  CDS  NC_014151  105688  106722  -  1035  Integral membrane protein TerC  YP_003635202  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0084  CDS  NC_014151  107101  107451  +  351  hypothetical protein  YP_003635203  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0085  CDS  NC_014151  107448  108083  +  636  hypothetical protein  YP_003635204  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0086  CDS  NC_014151  108278  109168  +  891  protein of unknown function DUF72  YP_003635205  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0087  CDS  NC_014151  109201  109575  +  375  hypothetical protein  YP_003635206  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0088  CDS  NC_014151  109768  110391  +  624  transcriptional regulator, TetR family  YP_003635207  normal  0.783228  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0089  CDS  NC_014151  110474  111409  +  936  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_003635208  normal  0.743714  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0090  CDS  NC_014151  111419  112567  -  1149  hypothetical protein  YP_003635209  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0091  CDS  NC_014151  112639  115287  -  2649  putative esterase  YP_003635210  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0092  CDS  NC_014151  115678  115851  -  174  hypothetical protein  YP_003635211  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0093  CDS  NC_014151  116415  119417  +  3003  glycine dehydrogenase  YP_003635212  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0094  CDS  NC_014151  119414  120619  +  1206  glycine cleavage system T protein  YP_003635213  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0095  CDS  NC_014151  120682  121053  +  372  glycine cleavage system H protein  YP_003635214  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0096  CDS  NC_014151  121388  121624  +  237  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003635215  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0097  CDS  NC_014151  121787  122242  +  456  NUDIX hydrolase  YP_003635216  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0098  CDS  NC_014151  122453  122959  +  507  heat shock protein Hsp20  YP_003635217  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0099  CDS  NC_014151  123159  124313  -  1155  aminotransferase class I and II  YP_003635218  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Cfla_0100  CDS  NC_014151  124352  125416  -  1065  hypothetical protein  YP_003635219  normal  1  normal  1  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>