35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0020 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  100 
 
 
83 aa  161  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  62.65 
 
 
81 aa  97.1  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  47.87 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  49.4 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000113441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  52.38 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  45.05 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  49.44 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  47.78 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  49.41 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  46.51 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  49.18 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000180482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  45.35 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  47.67 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  43.68 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  43.53 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  43.18 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  40.4 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  38.55 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  41.46 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  40.91 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  37.04 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  36.17 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  36.17 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  36.17 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  39.36 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  46.97 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  53.57 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  32.94 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  45.98 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  36.78 
 
 
87 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  36.56 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  34.41 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  41.38 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>