36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  100 
 
 		 87 aa  177  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  72.73 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  56.67 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  57.45 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  56.84 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  56.84 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  56.84 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  55.32 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0023  protein of unknown function UPF0233  62.89 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  53.54 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  53.19 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  54.74 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  47.73 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  43.68 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  45.98 
 
 		 83 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  44.83 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  40.91 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  41.38 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000113441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  39.77 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  41.11 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  36.67 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  41.38 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  41.67 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  37.93 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  47.46 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  38.64 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  37.08 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  31.46 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  38.46 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000180482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  32.63 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  32.58 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  35 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  46.15 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  41.67 
 
 		 130 aa  40  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  30.59 
 
 		 124 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  31.94 
 
 		 87 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>