36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0107 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  70.37 
 
 
81 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  58.82 
 
 
85 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  55.95 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  50 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  38.27 
 
 
81 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  40.48 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  41.86 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  37.08 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  40.66 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  38.55 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  40.91 
 
 
88 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  38.55 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  37.93 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  36.76 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000180482  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  37.5 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  34.09 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  35.37 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000113441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  35.63 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  35.11 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  35.11 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  35.11 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  34.41 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  34.41 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  32.18 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  31.25 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  33.33 
 
 
110 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  33.33 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  29.9 
 
 
97 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  35.59 
 
 
87 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  31.46 
 
 
87 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3067  hypothetical protein  43.4 
 
 
53 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000110577  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  26.87 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0023  protein of unknown function UPF0233  35.42 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0020  hypothetical protein  37.04 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>