26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  100 
 
 
124 aa  248  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  38.67 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000180482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  42.68 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  40.22 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  39.51 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  42.86 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  38.67 
 
 
83 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000113441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  46.97 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  30.83 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  37.62 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  36.05 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  37.33 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  40.28 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  40.32 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  39.77 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  41.38 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  33.75 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  33.33 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  38.64 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  40.54 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  31.25 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  37.25 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  40.38 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  31.17 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  26.6 
 
 
97 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>