25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0077 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  48.26 
 
 
311 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  47.48 
 
 
248 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  45.21 
 
 
217 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  43.58 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  40.51 
 
 
231 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  44.92 
 
 
295 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  39.85 
 
 
293 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  42.86 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  38.63 
 
 
291 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  36.3 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  35.63 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  33.64 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  31.61 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  28.68 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  28.11 
 
 
482 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  27.01 
 
 
275 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  29.52 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  27.7 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  30.36 
 
 
314 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  33.94 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  30.65 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  28.64 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  30.3 
 
 
313 aa  42.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>