3303 genes were found for organism Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
AFE_0001  CDS  NC_011761  86  1183  +  1098  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002424516  normal  0.336764  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0002  CDS  NC_011761  1185  2237  +  1053  DNA replication and repair protein RecF  YP_002424517  normal  0.617644  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0003  CDS  NC_011761  2237  4639  +  2403  DNA gyrase, B subunit  YP_002424518  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0004  CDS  NC_011761  4784  8290  +  3507  hypothetical protein  YP_002424519  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0005  CDS  NC_011761  8385  8897  +  513  spore coat protein  YP_002424520  normal  0.177415  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0006  CDS  NC_011761  8911  9654  +  744  pilus chaperone protein, putative  YP_002424521  normal  0.0451749  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0007  CDS  NC_011761  9620  12064  +  2445  outer membrane usher protein, putative  YP_002424522  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0008  CDS  NC_011761  12061  12525  +  465  spore coat protein  YP_002424523  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0009    NC_011761  12548  12676  -  129      normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0010  CDS  NC_011761  12684  13118  -  435  hypothetical protein  YP_002424524  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0011  CDS  NC_011761  13451  13702  -  252  cell division topological specificity factor MinE  YP_002424525  normal  0.982342  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0012  CDS  NC_011761  13704  14513  -  810  septum site-determining protein MinD  YP_002424526  normal  0.223944  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0013  CDS  NC_011761  14532  15215  -  684  septum site-determining protein MinC  YP_002424527  normal  0.838268  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0014  CDS  NC_011761  15294  15620  -  327  ferredoxin  YP_002424528  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0015  CDS  NC_011761  15617  18172  -  2556  DNA topoisomerase I  YP_002424529  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0016  CDS  NC_011761  18176  18616  -  441  smg family protein  YP_002424530  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0017  CDS  NC_011761  18626  19723  -  1098  DNA processing protein DprA, putative  YP_002424531  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0018  CDS  NC_011761  19720  20769  -  1050  LysM domain protein  YP_002424532  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0019  CDS  NC_011761  20852  21355  +  504  polypeptide deformylase  YP_002424533  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0020  CDS  NC_011761  21348  22289  +  942  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_002424534  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0021  CDS  NC_011761  22286  23590  +  1305  sun protein  YP_002424535  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0022  CDS  NC_011761  23581  24180  +  600  hypothetical protein  YP_002424536  normal  0.726972  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0023  CDS  NC_011761  24231  26363  +  2133  nitrogen regulation protein NtrY, putative  YP_002424537  normal  0.736908  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0024  CDS  NC_011761  26385  27791  +  1407  nitrogen assimilation regulatory protein NtrX, putative  YP_002424538  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0025  CDS  NC_011761  27788  27985  +  198  hypothetical protein  YP_002424539  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0026  CDS  NC_011761  28118  29713  +  1596  sensor histidine kinase  YP_002424540  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0027  CDS  NC_011761  29755  31122  +  1368  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  YP_002424541  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0028  CDS  NC_011761  33018  33254  -  237  hypothetical protein  YP_002424543  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0029  CDS  NC_011761  31545  33044  +  1500  tetrathionate hydrolase  YP_002424542  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0030  CDS  NC_011761  33338  34519  +  1182  hypothetical protein  YP_002424544  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0031  CDS  NC_011761  34591  35946  -  1356  tRNA modification GTPase TrmE  YP_002424545  normal  0.785205  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0032  CDS  NC_011761  35984  37570  -  1587  inner membrane protein, 60 kDa  YP_002424546  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0033  CDS  NC_011761  37586  37801  -  216  conserved hypothetical protein TIGR00278  YP_002424547  normal  0.97482  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0034  CDS  NC_011761  37798  38148  -  351  ribonuclease P protein component  YP_002424548  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0035  CDS  NC_011761  38153  38287  -  135  50S ribosomal protein L34  YP_002424549  normal  0.766539  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0036  CDS  NC_011761  38358  40025  -  1668  putative ABC transporter ATP-binding protein  YP_002424550  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0037  CDS  NC_011761  40123  41025  -  903  transcriptional regulator, LysR family  YP_002424551  normal  0.279269  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0038  CDS  NC_011761  41087  42199  -  1113  drug resistance secretion protein, putative  YP_002424552  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0039  CDS  NC_011761  42174  43628  -  1455  RND efflux system, drug efflux transporter, outer membrane lipoprotein  YP_002424553  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0040  CDS  NC_011761  43609  45231  -  1623  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  YP_002424554  normal  0.295395  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0041  CDS  NC_011761  45787  46944  +  1158  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  YP_002424555  normal  0.299856  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0042  CDS  NC_011761  46984  47796  +  813  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  YP_002424556  normal  0.325688  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0043  CDS  NC_011761  47821  48831  +  1011  periplasmic solute-binding protein, putative  YP_002424557  normal  0.0219043  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0044  CDS  NC_011761  48896  49966  +  1071  DoxD-like family protein  YP_002424558  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0045  CDS  NC_011761  50064  50711  +  648  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  YP_002424559  normal  0.972938  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0046  CDS  NC_011761  50772  51173  +  402  hypothetical protein  YP_002424560  normal  0.0363371  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0047  CDS  NC_011761  51204  51701  -  498  hypothetical protein  YP_002424561  normal  0.147207  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0048  CDS  NC_011761  51795  52877  -  1083  DoxD-like family protein  YP_002424562  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0049  CDS  NC_011761  52930  53943  -  1014  periplasmic solute-binding protein, putative  YP_002424563  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0050  CDS  NC_011761  53965  54777  -  813  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  YP_002424564  normal  0.0115926  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0051  CDS  NC_011761  54776  55309  +  534  hypothetical protein  YP_002424565  normal  0.144511  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0052  CDS  NC_011761  55329  55991  -  663  hypothetical protein  YP_002424566  normal  0.338571  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0053  CDS  NC_011761  56115  57149  -  1035  hypothetical protein  YP_002424567  normal  0.101016  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0054  CDS  NC_011761  57310  57960  -  651  integral membrane protein, MarC family  YP_002424568  normal  0.207585  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0055  CDS  NC_011761  58078  58335  +  258  hypothetical protein  YP_002424569  normal  0.130554  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0056  CDS  NC_011761  58419  60209  +  1791  aspartyl-tRNA synthetase  YP_002424570  normal  0.524796  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0057  CDS  NC_011761  60310  61392  +  1083  quinolinate synthetase  YP_002424571  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0058  CDS  NC_011761  61401  62012  +  612  acyltransferase family protein  YP_002424572  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0059  CDS  NC_011761  62092  62844  +  753  hypothetical protein  YP_002424573  normal  0.852085  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0060  CDS  NC_011761  62927  63427  +  501  Holliday junction resolvase  YP_002424574  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0061  CDS  NC_011761  63456  64037  +  582  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_002424575  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0062  CDS  NC_011761  64080  65102  +  1023  Holliday junction DNA helicase RuvB  YP_002424576  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0063  CDS  NC_011761  65092  65514  +  423  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  YP_002424577  normal  0.57846  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0064  CDS  NC_011761  65521  66222  +  702  TolQ protein  YP_002424578  normal  0.0296877  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0065  CDS  NC_011761  66219  66629  +  411  TolR protein  YP_002424579  normal  0.0122118  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0066  CDS  NC_011761  66626  67579  +  954  TolA protein  YP_002424580  normal  0.231101  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0067  CDS  NC_011761  67572  68840  +  1269  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  YP_002424581  normal  0.518188  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0068  CDS  NC_011761  68882  69571  -  690  exsB protein  YP_002424582  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0069  CDS  NC_011761  69574  70218  -  645  radical SAM domain protein  YP_002424583  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0070  CDS  NC_011761  70218  71036  -  819  hypothetical protein  YP_002424584  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0071  CDS  NC_011761  71057  71635  -  579  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  YP_002424585  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0072  CDS  NC_011761  71970  72170  +  201  hypothetical protein  YP_002424586  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0073  CDS  NC_011761  72256  73722  -  1467  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  YP_002424587  normal  0.412835  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0074  CDS  NC_011761  73707  74717  +  1011  chain length determinant family protein  YP_002424588  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0075  CDS  NC_011761  74805  75164  +  360  hypothetical protein  YP_002424589  normal  0.492239  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0076  CDS  NC_011761  75356  76855  +  1500  polysaccharide biosynthesis protein  YP_002424590  normal  0.160586  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0077  CDS  NC_011761  76845  77906  +  1062  hypothetical protein  YP_002424591  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0078  CDS  NC_011761  77969  78952  +  984  glycosyl transferase, group 2 family protein  YP_002424592  normal  0.780673  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0079  CDS  NC_011761  78949  80160  +  1212  glycosyltransferase, putative  YP_002424593  normal  0.471525  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0080  CDS  NC_011761  80176  81456  +  1281  hypothetical protein  YP_002424594  normal  0.0141112  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0081  CDS  NC_011761  81463  82503  +  1041  mannosyltransferase  YP_002424595  normal  0.54497  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0082  CDS  NC_011761  82571  83497  +  927  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  YP_002424596  normal  0.19572  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0083    NC_011761  83490  83858  +  369      normal  0.708712  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0084  tRNA  NC_011761  83987  84064  +  78  tRNA-Lys    normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0085  CDS  NC_011761  84598  84819  +  222  prevent-host-death family protein  YP_002424597  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0086  CDS  NC_011761  84819  85232  +  414  hypothetical protein  YP_002424598  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0087  CDS  NC_011761  85229  85519  +  291  hypothetical protein  YP_002424599  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0088  CDS  NC_011761  85685  85960  +  276  plasmid maintenance system killer protein  YP_002424600  normal  0.167827  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0089  CDS  NC_011761  85976  86293  +  318  DNA-binding protein, putative  YP_002424601  normal  0.993479  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0090  CDS  NC_011761  86308  86487  +  180  hypothetical protein  YP_002424602  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0091  CDS  NC_011761  86624  86884  -  261  hypothetical protein  YP_002424603  normal  0.855268  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0092  CDS  NC_011761  86994  88070  +  1077  fic family protein  YP_002424604  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0093    NC_011761  88203  88630  -  428      normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0094  CDS  NC_011761  88630  88938  -  309  prevent-host-death family protein  YP_002424605  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0095  CDS  NC_011761  88956  89129  -  174  hypothetical protein  YP_002424606  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0096  CDS  NC_011761  89240  89668  -  429  hypothetical protein  YP_002424607  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0097  CDS  NC_011761  89671  90102  -  432  hypothetical protein  YP_002424608  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0098  CDS  NC_011761  90248  92506  -  2259  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  YP_002424609  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0099  CDS  NC_011761  92626  93072  +  447  hypothetical protein  YP_002424610  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0100  CDS  NC_011761  93079  94164  -  1086  hypothetical protein  YP_002424611  normal  1  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>