30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0083 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0083    100 
 
 		 369 bp  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.708712  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0086  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 369 bp  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1357  glycosyl transferase, group 1  91.19 
 
 		 1152 bp  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.765434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  83.17 
 
 		 2574 bp  65.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0524  glycosyl transferase, group 1 family protein  84.27 
 
 		 1245 bp  65.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  88.14 
 
 		 2463 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  88.14 
 
 		 2463 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  88.14 
 
 		 2463 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  88.14 
 
 		 2463 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  88.14 
 
 		 2463 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  88.14 
 
 		 2571 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  88.14 
 
 		 2571 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3230  glycosyl transferase, group 1  83.72 
 
 		 1230 bp  60  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  82.65 
 
 		 2463 bp  60  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  85.29 
 
 		 1149 bp  56  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0733  glycosyl transferase group 1  83.75 
 
 		 1209 bp  56  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3448  glycosyl transferase, group 1 family protein  81.73 
 
 		 1230 bp  56  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  81.55 
 
 		 1209 bp  54  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  92.11 
 
 		 1308 bp  52  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  92.11 
 
 		 1170 bp  52  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  82.35 
 
 		 1251 bp  50.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1710  glycosyl transferase group 1  90.24 
 
 		 1197 bp  50.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2536  putative first mannosyl transferase,o- antigen biosynthesis  90.24 
 
 		 1224 bp  50.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  90.24 
 
 		 2469 bp  50.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  81.05 
 
 		 2466 bp  46.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  81.05 
 
 		 2466 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  88.37 
 
 		 2487 bp  46.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  88.37 
 
 		 2457 bp  46.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  89.74 
 
 		 1245 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 1386 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>