118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0086 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0086  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
122 aa  237  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089376  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1357  glycosyl transferase, group 1  86.09 
 
 
383 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.765434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3127  glycosyl transferase, group 1  59.13 
 
 
380 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.020191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  56.52 
 
 
385 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3230  glycosyl transferase, group 1  58.62 
 
 
409 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3448  glycosyl transferase, group 1 family protein  57.41 
 
 
409 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1681  glycosyl transferase, group 1  55.75 
 
 
383 aa  122  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2536  putative first mannosyl transferase,o- antigen biosynthesis  60.75 
 
 
407 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3728  glycosyl transferase group 1  52.78 
 
 
397 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0346462 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.11 
 
 
856 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.11 
 
 
856 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.11 
 
 
820 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.11 
 
 
820 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  61.11 
 
 
820 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  61.11 
 
 
820 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  61.11 
 
 
820 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  57.8 
 
 
821 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  57.8 
 
 
821 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  57.8 
 
 
821 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  58.33 
 
 
821 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1710  glycosyl transferase group 1  59.81 
 
 
398 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586278  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  58.33 
 
 
821 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  58.33 
 
 
819 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  59.26 
 
 
857 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  58.33 
 
 
822 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  55.45 
 
 
402 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  57.14 
 
 
818 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1127  glycosyl transferase group 1  55.45 
 
 
402 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  58.88 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  56.19 
 
 
820 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  53.51 
 
 
416 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0524  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.75 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6735  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  52.99 
 
 
742 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0032  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.88 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0810  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.88 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0314392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2880  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.88 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.447923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2204  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.88 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0647  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.88 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2502  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.88 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0300016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0632  glycosyl transferase, group 1  50.88 
 
 
413 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0733  glycosyl transferase group 1  50.91 
 
 
402 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0519502  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0294  aldehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
374 aa  107  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  54.21 
 
 
828 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6748  glycosyl transferase group 1  55.1 
 
 
422 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0836  glycosyl transferase group 1  46.55 
 
 
390 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.367499  normal  0.134682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  52.34 
 
 
382 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  48.6 
 
 
378 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  50.45 
 
 
389 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3320  glycosyl transferase group 1  43.36 
 
 
386 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2781  glycosyl transferase group 1  43.36 
 
 
386 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0349  glycosyl transferase, group 1  48.57 
 
 
398 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.329915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  47.79 
 
 
374 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  50.43 
 
 
402 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2100  glycosyl transferase, group 1  44.86 
 
 
381 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2690  group 1 glycosyl transferase  43.24 
 
 
378 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.823218  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  42.06 
 
 
364 aa  90.5  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3256  glycosyl transferase, group 1  41.03 
 
 
385 aa  90.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  41.03 
 
 
371 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  46.9 
 
 
410 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3393  glycosyl transferase group 1  43.93 
 
 
378 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2594  glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 
399 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0321424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3451  glycosyl transferase group 1  47.66 
 
 
412 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  43.59 
 
 
409 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  44.14 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  38.39 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  38.39 
 
 
407 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  44.35 
 
 
389 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  38.39 
 
 
407 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0859  glycosyl transferase group 1  38.05 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984079  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 
363 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  42.2 
 
 
389 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  41.35 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4558  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
381 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478096  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  38.94 
 
 
414 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  42.86 
 
 
380 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  38.74 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 
372 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 
372 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 
372 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  43.12 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3774  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3401  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
414 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3129  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
414 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0479  putative glycosyltransferase  42.86 
 
 
366 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1577  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
371 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0548875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1177  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
382 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3126  group 1 glycosyl transferase  35.16 
 
 
366 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.154017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
363 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4009  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
361 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1115  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
362 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.282541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
365 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3205  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
387 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  38.57 
 
 
369 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
854 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  35.48 
 
 
360 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  61.29 
 
 
406 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0019  glycosyl transferase group 1  48.78 
 
 
370 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0112431  normal  0.0520774 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0274  glycosyl transferase group 1  52.63 
 
 
378 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
363 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>