More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1032 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1032  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  967    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0999  hypothetical protein  99.59 
 
 		 487 aa  964    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1373  amino acid permease-associated region  54.56 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0968  amino acid permease-associated region  41.91 
 
 		 510 aa  339  8e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  37.82 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 473 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  37.61 
 
 		 473 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  37.61 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  37.61 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  37.5 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  37.61 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  38.27 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  37.39 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  39.76 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  38.27 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  36.68 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  38.22 
 
 		 475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  38.22 
 
 		 475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  36.13 
 
 		 474 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  36.68 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  36.24 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  35.92 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  36.67 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  36.46 
 
 		 474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  35.7 
 
 		 513 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  36.95 
 
 		 474 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  36.74 
 
 		 478 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 		 476 aa  299  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  36.33 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  36.33 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  37.27 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 468 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  37.27 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  37.27 
 
 		 470 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  35.1 
 
 		 468 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  36.76 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  35.21 
 
 		 474 aa  270  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  34.86 
 
 		 458 aa  269  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  33.26 
 
 		 524 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  34.31 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  34.31 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  34.31 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  34.31 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  34.31 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  34.31 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  36.36 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  36.36 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  36.36 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  36.36 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  36.36 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  36.83 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  33.98 
 
 		 527 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 490 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  31.56 
 
 		 466 aa  263  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  36.6 
 
 		 489 aa  263  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  34.24 
 
 		 469 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  34.41 
 
 		 520 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  34.83 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  34.83 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  34.83 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  34.83 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  34.83 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  36.77 
 
 		 489 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  33.99 
 
 		 463 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 462 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 459 aa  260  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  33.99 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  32.69 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 536 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  35.46 
 
 		 465 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  33.55 
 
 		 463 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  33.55 
 
 		 463 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 526 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 526 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  33.55 
 
 		 463 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  33.55 
 
 		 463 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 526 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  33.55 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  31.92 
 
 		 475 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  35.94 
 
 		 493 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  32.32 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  35.81 
 
 		 526 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  35.58 
 
 		 526 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  37.14 
 
 		 488 aa  256  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 		 538 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 		 538 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>