30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0021 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  100 
 
 		 428 aa  876    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  39.23 
 
 		 442 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  37.3 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  35.08 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  34.47 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  34.7 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  33.89 
 
 		 448 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  36.32 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  36.32 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  29.21 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  29.21 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  26.76 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1986  type IV prepilin  29.51 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.610006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  29.51 
 
 		 560 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  29.51 
 
 		 560 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0665  type IV prepilin  29.51 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  29.51 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  31.14 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  29.23 
 
 		 560 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  28.57 
 
 		 560 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  32.12 
 
 		 507 aa  94  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  46.91 
 
 		 899 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7249  hypothetical protein  24.82 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5917  type IV prepilin  32.42 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.136349  normal  0.0238074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  23.06 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  29.01 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5873  type IV prepilin  33.97 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  24.11 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  21.84 
 
 		 512 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6288  hypothetical protein  33.04 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>