17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2071 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  100 
 
 		 478 aa  963    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  50.11 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  51.31 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0064  hypothetical protein  32.91 
 
 		 457 aa  100  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583147 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6288  hypothetical protein  26.7 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7249  hypothetical protein  29.59 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  26.14 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  25.7 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  25.91 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4765  hypothetical protein  24.94 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  40.78 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  25 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4492  methylation  24.37 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  24.46 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  41.98 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6558  hypothetical protein  26.69 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  30.92 
 
 		 1584 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>