15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1761 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  79.78 
 
 		 482 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  100 
 
 		 512 aa  1022    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  47.36 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0064  hypothetical protein  33.47 
 
 		 457 aa  100  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583147 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7249  hypothetical protein  26.01 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6288  hypothetical protein  26.15 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4765  hypothetical protein  26.86 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6558  hypothetical protein  28.12 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  22.69 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  25.52 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  32.08 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  25.07 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  21.38 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  24.34 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5558  hypothetical protein  34.34 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363207  normal  0.0854155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>