More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1229 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1229  sugar ABC transporter permease  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.446632 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  95.44 
 
 		 329 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  95.44 
 
 		 329 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  80.49 
 
 		 329 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  53.61 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  53.61 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  53.61 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  47.63 
 
 		 324 aa  266  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  39.74 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  39.41 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  38.51 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  39.06 
 
 		 343 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3637  monosaccharide-transporting ATPase  41.95 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3561  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.67 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  32.59 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.13 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  34.8 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  30.4 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4061  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  31.46 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.17 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.22 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4659  monosaccharide-transporting ATPase  34.21 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225069  normal  0.765727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30.89 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  32.06 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.98 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.54 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3819  monosaccharide-transporting ATPase  33.89 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.9 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  30.19 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1268  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.07 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5190  Monosaccharide-transporting ATPase  34.87 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.91 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.72 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.46 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  29.65 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.38 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.38 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.91 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.29 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.76 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.46 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  30.29 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1338  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  29.23 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  29.74 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  33.01 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  30.95 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  30.03 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.09 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  31.11 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>