72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0115 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0115  putative transposase  100 
 
 
101 aa  206  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.91333e-16  hitchhiker  6.87308e-79 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  83.91 
 
 
313 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  82.09 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  68.49 
 
 
318 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  47.76 
 
 
319 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  47.76 
 
 
319 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  47.76 
 
 
319 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  42.86 
 
 
310 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  48.61 
 
 
311 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  48.61 
 
 
311 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  48.61 
 
 
311 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  47.69 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  47.76 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  49.23 
 
 
316 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  40.3 
 
 
308 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  56.36 
 
 
296 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  38.46 
 
 
304 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  38.46 
 
 
304 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  38.46 
 
 
304 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  38.46 
 
 
304 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  42.86 
 
 
309 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  38.71 
 
 
334 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05826  hypothetical protein  44.9 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  39.06 
 
 
300 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  40.3 
 
 
319 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  38.81 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  35.79 
 
 
320 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  40.3 
 
 
308 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  36.67 
 
 
314 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  40.28 
 
 
300 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  41.67 
 
 
302 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  40.28 
 
 
238 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  45 
 
 
309 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  36.67 
 
 
314 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  45 
 
 
309 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  37.04 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  37.04 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  37.04 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  37.04 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  37.04 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  37.04 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  38.46 
 
 
292 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  38.46 
 
 
292 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  40.58 
 
 
298 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  40.58 
 
 
298 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  42.86 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  31.94 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  35.21 
 
 
298 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  31.94 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  31.94 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  42.86 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  31.94 
 
 
299 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  42.86 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  31.94 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  31.94 
 
 
299 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  42.86 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  31.94 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  35.8 
 
 
292 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  44.64 
 
 
313 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  44.64 
 
 
313 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  44.64 
 
 
313 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  43.14 
 
 
296 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  43.14 
 
 
296 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  43.14 
 
 
296 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  43.14 
 
 
296 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  40.43 
 
 
255 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  38 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  43.14 
 
 
296 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  41.18 
 
 
296 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  41.82 
 
 
331 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  40.32 
 
 
310 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  40.38 
 
 
313 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>