28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0930 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1079    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  63.84 
 
 		 589 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  41.53 
 
 		 670 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  41.53 
 
 		 670 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  43.53 
 
 		 701 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  34.69 
 
 		 690 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  38.93 
 
 		 768 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  37.27 
 
 		 654 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  36.96 
 
 		 654 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  40.29 
 
 		 612 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  33.54 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  36.43 
 
 		 804 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  33.15 
 
 		 808 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  34 
 
 		 609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  34.21 
 
 		 268 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  41.54 
 
 		 249 aa  90.1  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  40.69 
 
 		 580 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  54 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  47.69 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  58.7 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  39.81 
 
 		 554 aa  57  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  60.47 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  60.47 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  60.47 
 
 		 581 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  64.29 
 
 		 660 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  26.17 
 
 		 190 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  37.14 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>