34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1010 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  100 
 
 
301 aa  630  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  53.63 
 
 
311 aa  328  7e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  53.33 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  27.73 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  26.24 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  27.02 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  29 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  30.62 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  25.93 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  24.51 
 
 
328 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  24.81 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  29.84 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  27.75 
 
 
343 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  27.36 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  23.51 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  27.17 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  23.73 
 
 
327 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  25.99 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  35.48 
 
 
390 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  27.86 
 
 
372 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  27.37 
 
 
361 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  28.45 
 
 
352 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  27.1 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  28.65 
 
 
383 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  27.46 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  29.03 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  21.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  25.24 
 
 
356 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  30 
 
 
349 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  24.49 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  29.85 
 
 
407 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  28.72 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  26.67 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  26.67 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>