More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2219 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  100 
 
 		 94 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  81.32 
 
 		 104 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  79.57 
 
 		 96 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 		 101 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 		 101 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  78.49 
 
 		 97 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  78.49 
 
 		 106 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  77.42 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  75.82 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  76.34 
 
 		 103 aa  147  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  78.02 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  78.02 
 
 		 102 aa  146  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  78.02 
 
 		 102 aa  146  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  72.04 
 
 		 110 aa  145  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  71.28 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  73.63 
 
 		 95 aa  144  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  72.53 
 
 		 95 aa  143  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  72.04 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  73.63 
 
 		 94 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  71.74 
 
 		 93 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  72.53 
 
 		 94 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  72.53 
 
 		 94 aa  140  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  71.28 
 
 		 99 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  72.04 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  71.28 
 
 		 99 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  72.53 
 
 		 94 aa  140  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  70.65 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  70.65 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  68.09 
 
 		 101 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  67.74 
 
 		 98 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  68.13 
 
 		 95 aa  136  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  70.33 
 
 		 92 aa  134  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  64.84 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  64.13 
 
 		 94 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  56.99 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  59.78 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  53.76 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  53.76 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  55.43 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  54.35 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  51.06 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  52.17 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  50.55 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2004  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.143906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2338  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000102507  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1736  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.060047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2236  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00572513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6375  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6405  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>