More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0625 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
378 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  74.07 
 
 
373 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  59.42 
 
 
378 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  61.01 
 
 
378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
378 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.27 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  59.47 
 
 
382 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  59.41 
 
 
379 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  62.86 
 
 
378 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  59.09 
 
 
377 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  58.33 
 
 
385 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  48.69 
 
 
384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.71 
 
 
400 aa  352  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.23 
 
 
390 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
390 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  47.62 
 
 
398 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  48.44 
 
 
390 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
390 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.76 
 
 
402 aa  335  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  47.61 
 
 
390 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
396 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  47.87 
 
 
390 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  45.9 
 
 
394 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.23 
 
 
398 aa  329  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.48 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.73 
 
 
392 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 
390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.75 
 
 
403 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  46.52 
 
 
404 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
399 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.72 
 
 
399 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.6 
 
 
395 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  46.97 
 
 
399 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
399 aa  319  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.75 
 
 
392 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  45.18 
 
 
398 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 
398 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.25 
 
 
406 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 
400 aa  315  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  46.23 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
399 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  46.83 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 
412 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  46.93 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 
391 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.94 
 
 
424 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  45.59 
 
 
391 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  49.49 
 
 
391 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  46.83 
 
 
391 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 
399 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.03 
 
 
401 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  45.36 
 
 
401 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  44.59 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  45.64 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.38 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
405 aa  309  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.68 
 
 
401 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.99 
 
 
391 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
390 aa  308  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  43.99 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  42.53 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.25 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
401 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
405 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  43.67 
 
 
405 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
401 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  46.09 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  44.27 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
399 aa  305  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.77 
 
 
399 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.25 
 
 
406 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.14 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  47.75 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  43.42 
 
 
405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  43.42 
 
 
405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
406 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.25 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  42.33 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  44.19 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>