88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0506 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  40 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  37.13 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  36.53 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  36.36 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  36.45 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  35.55 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  36.04 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  36.33 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  34.44 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  34.2 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  34.45 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  46.51 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  42.53 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  34.78 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  34.57 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  31.15 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  25.5 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  31.25 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  31.25 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  40.23 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  25.96 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  36.46 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  41.24 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  34.51 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  41.24 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  34.78 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  34.44 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  36.15 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  33.63 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  33.82 
 
 		 280 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  27.86 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  28.89 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  31.85 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  36.99 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  34.48 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  35.17 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  32.43 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  34.38 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  31.91 
 
 		 220 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  28.19 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2540  hypothetical protein  35.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  36.13 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  30.81 
 
 		 239 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  27.84 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  30.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  31.75 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  52.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  37.37 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  27.57 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  27.57 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  26.9 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  31.43 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  27.57 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  30.54 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  30.23 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  29.02 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  31.29 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  32.21 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  30.37 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  34.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  29.1 
 
 		 234 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  35.58 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.94 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  26.75 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  26.42 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  34.38 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  32.41 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  24.31 
 
 		 245 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  32.1 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  26.4 
 
 		 251 aa  45.8  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  30.28 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  28.04 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  31.25 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  26.06 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  31.06 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  24.73 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  28.18 
 
 		 232 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  32.14 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>