More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0468 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0468  CTP synthetase  100 
 
 
529 aa  1094    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  56.8 
 
 
542 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  56.98 
 
 
542 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0114  CTP synthetase  63.76 
 
 
538 aa  703    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.462919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  58.96 
 
 
542 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0171  CTP synthetase  63.07 
 
 
532 aa  693    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  55.49 
 
 
545 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  56.98 
 
 
542 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  57.25 
 
 
543 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  57.17 
 
 
542 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  56.98 
 
 
542 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  56.98 
 
 
542 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  56.05 
 
 
542 aa  629  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  57.51 
 
 
544 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  56.98 
 
 
555 aa  631  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  57.7 
 
 
543 aa  627  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2765  CTP synthetase  56.75 
 
 
550 aa  625  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000226127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  56.32 
 
 
543 aa  623  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  56.16 
 
 
557 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1452  CTP synthetase  56.05 
 
 
542 aa  621  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3231  CTP synthetase  58.02 
 
 
543 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  57.65 
 
 
543 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  56.82 
 
 
545 aa  624  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  56.16 
 
 
542 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  55.24 
 
 
542 aa  624  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  57.28 
 
 
543 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  56.77 
 
 
547 aa  619  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  56.05 
 
 
542 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  57.09 
 
 
543 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  55.08 
 
 
553 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  56.16 
 
 
542 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  56.53 
 
 
543 aa  615  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  56.76 
 
 
534 aa  617  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  57.09 
 
 
543 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  55.43 
 
 
542 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0530  CTP synthetase  56.61 
 
 
542 aa  615  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  54.43 
 
 
536 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  54.38 
 
 
543 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  55.87 
 
 
543 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  55.06 
 
 
542 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  55.58 
 
 
548 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1973  CTP synthetase  56.19 
 
 
547 aa  611  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  55.04 
 
 
542 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  54.72 
 
 
534 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  55.53 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000244608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  54.92 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  56.03 
 
 
547 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  56.42 
 
 
542 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  55.35 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  54.46 
 
 
542 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  54.92 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  55.04 
 
 
545 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  54.46 
 
 
542 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  55.95 
 
 
547 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  54.8 
 
 
542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  54.92 
 
 
542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  55.9 
 
 
546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  53.13 
 
 
534 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0873  CTP synthetase  54.9 
 
 
547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.666117  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  55.16 
 
 
545 aa  598  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  54.71 
 
 
547 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  54.71 
 
 
547 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  52.92 
 
 
538 aa  601  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  53.12 
 
 
534 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  55.16 
 
 
545 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  54.78 
 
 
545 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  54.95 
 
 
545 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  54.97 
 
 
545 aa  596  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  54.78 
 
 
546 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  55.24 
 
 
545 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.11 
 
 
533 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  54.15 
 
 
540 aa  594  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  54.39 
 
 
544 aa  591  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  55.11 
 
 
547 aa  591  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  54.6 
 
 
545 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  54.97 
 
 
545 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  54.24 
 
 
533 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  54.41 
 
 
545 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  53.75 
 
 
547 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  52.6 
 
 
543 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  54.58 
 
 
545 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  54.22 
 
 
535 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  54.22 
 
 
535 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  54.97 
 
 
545 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  54.97 
 
 
545 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  54.97 
 
 
545 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  53.46 
 
 
542 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  53.75 
 
 
542 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  55.3 
 
 
534 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  54.1 
 
 
543 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  55.04 
 
 
544 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  54.77 
 
 
545 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  54.97 
 
 
545 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  52.97 
 
 
543 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.14 
 
 
555 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  54.17 
 
 
543 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  53.83 
 
 
545 aa  588  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  54.77 
 
 
545 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  53.46 
 
 
542 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  53.04 
 
 
557 aa  589  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>