55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_R0003 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0021  tRNA-Leu  96.74 
 
 		 92 bp  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  94.57 
 
 		 92 bp  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0041  tRNA-Leu  94.57 
 
 		 91 bp  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2624  hypothetical protein  96.67 
 
 		 702 bp  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.0379727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  85.87 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  85.87 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0025  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0025  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.680861  decreased coverage  0.000577389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0015  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04001  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000386269  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0048  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000432662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0031  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>