31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1272 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  910    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  47.62 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  47.3 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  49.19 
 
 		 457 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  40.8 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  27.3 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  30.95 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  36.09 
 
 		 217 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  36.36 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.32 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  29.67 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  37.07 
 
 		 282 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  37.82 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.36 
 
 		 293 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  30.32 
 
 		 281 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  28.92 
 
 		 286 aa  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  28.07 
 
 		 222 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  32.37 
 
 		 282 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  24.9 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  37.8 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.27 
 
 		 276 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  27.78 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  31.15 
 
 		 280 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  34.11 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  26.6 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  27.98 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  27.55 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.82 
 
 		 281 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  30 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  34.78 
 
 		 314 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>