More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0545 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  37.05 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  35.8 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1469  protein serine/threonine phosphatase  38.66 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  36.15 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  38.34 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  34.11 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  33.47 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  35.86 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  35.08 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  37.67 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  36.95 
 
 		 306 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.25 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  35.68 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  34.4 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  32.92 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.67 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  32.24 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  35.62 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  33.72 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.62 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1212  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 		 770 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.86 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  30.74 
 
 		 455 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  32.27 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  34.03 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.01 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  30.31 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  34.02 
 
 		 633 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  35.68 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.07 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  36.28 
 
 		 425 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  41.99 
 
 		 479 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  33.61 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 		 500 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  37.24 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  35.29 
 
 		 469 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  37.27 
 
 		 449 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  34.86 
 
 		 617 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  34.8 
 
 		 507 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  31.82 
 
 		 558 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  38.16 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.46 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  32.34 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  34.56 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  36.76 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  32.23 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 		 386 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  34.96 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.6 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  34.58 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  35.68 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 		 394 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  31.69 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 		 462 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  38.42 
 
 		 478 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  36.4 
 
 		 452 aa  97.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 		 567 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  31.95 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  37.26 
 
 		 463 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  34.36 
 
 		 421 aa  96.3  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.46 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  31.82 
 
 		 258 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  28.37 
 
 		 241 aa  95.5  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.37 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 		 597 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.02 
 
 		 554 aa  95.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.47 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.09 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  37.5 
 
 		 519 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  37.56 
 
 		 467 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  37.16 
 
 		 564 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  35.03 
 
 		 477 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  33.47 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  35.26 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  33.05 
 
 		 571 aa  93.2  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.73 
 
 		 404 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  33.01 
 
 		 505 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  34.82 
 
 		 463 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  31.85 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.74 
 
 		 239 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.96 
 
 		 611 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  31.15 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  32.56 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  30.54 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  32.43 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  32.06 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>