More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1255 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.26 
 
 
283 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  44.01 
 
 
376 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  44.01 
 
 
376 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  43.45 
 
 
376 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  46.04 
 
 
375 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
379 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
379 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
379 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  44.38 
 
 
377 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  44.96 
 
 
377 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  42.52 
 
 
377 aa  249  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  43.19 
 
 
372 aa  248  9e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
382 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
379 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  40.4 
 
 
375 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
380 aa  231  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  40.23 
 
 
374 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 
380 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  39.88 
 
 
373 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  41.06 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  40.29 
 
 
368 aa  225  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  41.57 
 
 
374 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
368 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  40.46 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  36.89 
 
 
372 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 
378 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  41.31 
 
 
375 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
373 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  39.29 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  43.69 
 
 
326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  41.2 
 
 
298 aa  211  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
382 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40.71 
 
 
325 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  37.47 
 
 
382 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  39.71 
 
 
376 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  41.41 
 
 
375 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  38.03 
 
 
381 aa  209  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.43 
 
 
334 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  42.13 
 
 
376 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
379 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
386 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  38.61 
 
 
380 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
379 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 
307 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  43.13 
 
 
301 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  35.33 
 
 
376 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  39.49 
 
 
302 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  42.21 
 
 
325 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  41.61 
 
 
299 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1471  chaperone protein DnaJ  39.94 
 
 
381 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00621305  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  38.38 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  42.41 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  36.72 
 
 
378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.61 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  35.42 
 
 
385 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  37.86 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40 
 
 
336 aa  195  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  36.08 
 
 
313 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2290  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
375 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  35.83 
 
 
374 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2664  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
375 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  37.04 
 
 
287 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  35.41 
 
 
373 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  36.56 
 
 
324 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.38 
 
 
341 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  41.48 
 
 
309 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.38 
 
 
313 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  37.12 
 
 
374 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  36.83 
 
 
378 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
374 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  35.96 
 
 
388 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.94 
 
 
324 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
369 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  40.14 
 
 
296 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
372 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1165  chaperone protein DnaJ  36.64 
 
 
372 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  37.28 
 
 
370 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.6 
 
 
289 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  34.59 
 
 
311 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.31 
 
 
392 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  39.38 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.84 
 
 
330 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  42.17 
 
 
332 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  33.13 
 
 
339 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  37.37 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  39.67 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  35.92 
 
 
333 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  39.81 
 
 
299 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.91 
 
 
328 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  37.04 
 
 
297 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>