48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1088 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  45.65 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  45.12 
 
 		 183 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  50.74 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  46.45 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  42.7 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  41.92 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  45.81 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  45.81 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  45.45 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  45.81 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  45.81 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  44.37 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  39.34 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  45.28 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  49.65 
 
 		 218 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  41.42 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  45.89 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  44.65 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  45.32 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  42.59 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  43.87 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  37.43 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  44 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1827  hypothetical protein  47.71 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  42.36 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  30.46 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  29.8 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  31.58 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3112  rhomboid family protein  34.25 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  29.73 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  32.97 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  30.68 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  28.33 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 342 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  27.5 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 342 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  31.01 
 
 		 369 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  31.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  31.78 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  29.79 
 
 		 268 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1093  Rhomboid family protein  25.21 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  37.78 
 
 		 289 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  37.78 
 
 		 289 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  37.78 
 
 		 289 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  28.83 
 
 		 211 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  30.53 
 
 		 291 aa  41.6  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>