More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0977 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
369 aa  744    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  76.57 
 
 
379 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  76.02 
 
 
379 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  74.45 
 
 
377 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  66.76 
 
 
367 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  65.48 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  65.48 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  65.48 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  66.12 
 
 
367 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  65.48 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  65.48 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
367 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  67.31 
 
 
367 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  67.31 
 
 
367 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  67.31 
 
 
367 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  65.66 
 
 
374 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  64.84 
 
 
372 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  64.38 
 
 
370 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  64.29 
 
 
372 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  64.09 
 
 
372 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  64.09 
 
 
372 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  64.09 
 
 
372 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  64.09 
 
 
372 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  64.93 
 
 
367 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  65.93 
 
 
367 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  64.29 
 
 
369 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  63.17 
 
 
379 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  65.11 
 
 
367 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  63.19 
 
 
372 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  64.84 
 
 
367 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  64.56 
 
 
372 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  64.29 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  64.29 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  64.01 
 
 
372 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  64.64 
 
 
372 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  60.54 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 
378 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  52.5 
 
 
363 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  51.77 
 
 
367 aa  362  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  51.38 
 
 
393 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  50.56 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  47.95 
 
 
373 aa  342  9e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
373 aa  341  1e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  54.55 
 
 
370 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 
373 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  46.99 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
372 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.03 
 
 
372 aa  305  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
373 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.68 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  47.12 
 
 
374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
373 aa  301  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 
368 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
373 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
372 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  44.23 
 
 
371 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  42.58 
 
 
390 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 
372 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  46.45 
 
 
373 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
376 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  44.81 
 
 
372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  45.81 
 
 
373 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  45.81 
 
 
373 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
372 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  44.51 
 
 
366 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.13 
 
 
376 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  41.48 
 
 
365 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.13 
 
 
376 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.41 
 
 
376 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 
373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  42.7 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  45.11 
 
 
376 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
367 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  45.23 
 
 
372 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 
372 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>