60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06503 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  100 
 
 		 695 aa  1380    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  33.28 
 
 		 712 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  33.53 
 
 		 679 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  34.32 
 
 		 691 aa  293  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  33.19 
 
 		 681 aa  293  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  34.5 
 
 		 688 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  34.64 
 
 		 672 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  34.46 
 
 		 688 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  33.28 
 
 		 748 aa  287  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  32.08 
 
 		 668 aa  287  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  32.93 
 
 		 700 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  34.41 
 
 		 644 aa  283  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  33.89 
 
 		 667 aa  263  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  26.98 
 
 		 592 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  26.98 
 
 		 592 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  26.77 
 
 		 592 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  26.42 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  26.42 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  26.42 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  26.42 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  26.46 
 
 		 585 aa  107  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  27 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  26.77 
 
 		 592 aa  106  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  26.72 
 
 		 590 aa  104  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  26.42 
 
 		 568 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  27.52 
 
 		 589 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  25.58 
 
 		 604 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  26.73 
 
 		 553 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  25.71 
 
 		 553 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  25.71 
 
 		 553 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.73 
 
 		 553 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  26.53 
 
 		 558 aa  97.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  25.71 
 
 		 549 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  25.71 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  26.85 
 
 		 744 aa  94  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.72 
 
 		 553 aa  94  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  25.72 
 
 		 542 aa  92  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  25.12 
 
 		 585 aa  91.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  26.43 
 
 		 560 aa  91.3  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  25.5 
 
 		 595 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  26.17 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  25.75 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  23.89 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  24.71 
 
 		 587 aa  84  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  25.18 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  23.42 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  24.69 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  24.45 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  24.69 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  24.69 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  28.03 
 
 		 964 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  24.45 
 
 		 559 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  22.26 
 
 		 693 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  23.19 
 
 		 672 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  23.66 
 
 		 504 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  22.83 
 
 		 490 aa  51.2  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  25.25 
 
 		 507 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  23.08 
 
 		 482 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  23.2 
 
 		 473 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  21.34 
 
 		 519 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>