48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06281 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  197  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  78.43 
 
 		 106 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  84.47 
 
 		 103 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  70.3 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  54 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  57.29 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  57.29 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  54 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  54 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  54 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  54 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  56.25 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  54 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  55 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  58.59 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  52.04 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  60 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  51.02 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  47.57 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  51.46 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  42.72 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  36.63 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  35.11 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  42.55 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  41.76 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  39.02 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  42.42 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  41.58 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  34.65 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  37.88 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  35.94 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  43.28 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  41.79 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  40.62 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  32.58 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  35.05 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  37.11 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  32.38 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  41.79 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>