More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001625 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  47.5 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  50.21 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  46.04 
 
 		 266 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  49.79 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  43.68 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  43.3 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  46.72 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  46.72 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  47.5 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  47.19 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  47.19 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  46.35 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  46.35 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  46.35 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  42.53 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  50.42 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  45.08 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  48.29 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  47.26 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  47.26 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  49.36 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  47.26 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  45.97 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  46.86 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.54 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  45 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  45.26 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  48.37 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  48.08 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  47.97 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  47.13 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  46.15 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.97 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.97 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.97 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.97 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.79 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  46.59 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.97 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  46.59 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  47.15 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.56 
 
 		 272 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  42.41 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  45.99 
 
 		 263 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  41.7 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  47.68 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  48.95 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  47.41 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  44.88 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  45.49 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  48.1 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  45.15 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  47.48 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  45.49 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  48.1 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  44.3 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  47.92 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  44.67 
 
 		 268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  41.91 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  44.67 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  47.26 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  45.42 
 
 		 529 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  47.5 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  46.84 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  46.84 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  45.49 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  45.49 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  43.03 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  45.08 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  45.08 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  44.67 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  44.67 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  47.47 
 
 		 246 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  41.8 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  42.26 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  43.04 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  42.91 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.11 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  41.8 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  42.07 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.28 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.28 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.28 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.28 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.28 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.7 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.89 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.95 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.95 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.52 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.95 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  39.93 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.51 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  44.27 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  44.27 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.27 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.27 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.27 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.27 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>