More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001572 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  100 
 
 
242 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  93.8 
 
 
247 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0701  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 
247 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  65.29 
 
 
249 aa  329  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  63.64 
 
 
249 aa  322  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  63.64 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1656  arginine transporter ATP-binding subunit  62.81 
 
 
242 aa  318  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.563363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  64.05 
 
 
249 aa  319  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2625  arginine transporter ATP-binding subunit  62.81 
 
 
242 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2710  arginine transporter ATP-binding subunit  62.81 
 
 
259 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  62.81 
 
 
259 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00869  arginine transporter subunit  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2778  ABC transporter related protein  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0132632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0937  arginine transporter ATP-binding subunit  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2467  arginine transporter ATP-binding subunit  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1024  arginine transporter ATP-binding subunit  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0892  arginine transporter ATP-binding subunit  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.964935  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0968  arginine transporter ATP-binding subunit  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2732  arginine transporter ATP-binding subunit  61.98 
 
 
242 aa  314  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.201208  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0251  arginine transporter ATP-binding subunit  62.55 
 
 
269 aa  312  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000905563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0928  arginine transporter ATP-binding subunit  61.57 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1026  arginine transporter ATP-binding subunit  61.57 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0995  arginine transporter ATP-binding subunit  61.57 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.938307  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1045  arginine transporter ATP-binding subunit  61.57 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0963  arginine transporter ATP-binding subunit  61.57 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1380  arginine transporter ATP-binding subunit  61.98 
 
 
242 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.374125  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
242 aa  278  8e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  50 
 
 
619 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.18 
 
 
594 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.59 
 
 
597 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.18 
 
 
594 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
240 aa  248  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 
244 aa  248  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  48.54 
 
 
244 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  49.59 
 
 
597 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.59 
 
 
597 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
244 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  45.93 
 
 
268 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
244 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
240 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.39 
 
 
595 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 
244 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 
244 aa  244  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1120  ABC transporter related  47.18 
 
 
249 aa  244  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.54 
 
 
592 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
244 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 
244 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 
244 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.52 
 
 
244 aa  239  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.93 
 
 
581 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  47.97 
 
 
261 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
261 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  49.78 
 
 
256 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
240 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
240 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
240 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
240 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
240 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  45.27 
 
 
299 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
240 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  48.75 
 
 
247 aa  236  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 
244 aa  235  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  45.04 
 
 
256 aa  235  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1595  arginine transport ATP-binding protein  50 
 
 
250 aa  234  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.552324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0590  arginine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
250 aa  234  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.501959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  42.86 
 
 
258 aa  234  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  45.45 
 
 
363 aa  234  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  49.17 
 
 
286 aa  233  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  45.04 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  46.89 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.09 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  48.12 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 
240 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  45.64 
 
 
240 aa  232  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 
240 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.77 
 
 
636 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  48.77 
 
 
636 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  45.64 
 
 
240 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.77 
 
 
636 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 
240 aa  232  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.72 
 
 
595 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  48.77 
 
 
636 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 
240 aa  232  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.77 
 
 
636 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.77 
 
 
636 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 
240 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  43.82 
 
 
258 aa  231  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  44.49 
 
 
244 aa  231  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  44.13 
 
 
256 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  45.64 
 
 
243 aa  231  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.23 
 
 
240 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  43.82 
 
 
274 aa  231  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 
598 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>