20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001259 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  971    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  94.21 
 
 		 380 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  36.44 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05134  hypothetical protein  91.76 
 
 		 85 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  34.41 
 
 		 591 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1123 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  28.72 
 
 		 571 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  30.99 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  26.88 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  33.63 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  37.63 
 
 		 601 aa  57  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  29.01 
 
 		 783 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  37.08 
 
 		 317 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  39.76 
 
 		 588 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1152 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  28.8 
 
 		 956 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  41.27 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  46.94 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  36.54 
 
 		 757 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>