34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000507 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  66.67 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  30.07 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  29.18 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  28.35 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  28.35 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  27.59 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  28.3 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  27.78 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  27.2 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  27.06 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  26.98 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  26.59 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  25.87 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  27.1 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  25.21 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  24.62 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  25.74 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  25.56 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  24.25 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  29.32 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  21.31 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  23.67 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  20.3 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  24.06 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  24.06 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  23.89 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  27.61 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  25.93 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  26.47 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  19.76 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>