32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1105 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  51.95 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  52.32 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  32.91 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  33.55 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  30.87 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  27.89 
 
 		 222 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  28.1 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  29.81 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  30.52 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  31.43 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  32.76 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  33.94 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  36.7 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  38.68 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  30.39 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  34.86 
 
 		 218 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  31.45 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  34.86 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  32.77 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  33.94 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  29.27 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  32.94 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  35.29 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  35.29 
 
 		 197 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  31.07 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  26.32 
 
 		 394 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  34.31 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>