More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0138 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0138  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 436 aa  877    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.408298  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0110  cysteinyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0240951  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl087  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.29436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 466 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 470 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 465 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 465 aa  299  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 466 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 472 aa  293  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 466 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 466 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 466 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 500 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 466 aa  279  9e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 472 aa  277  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 480 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 485 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 469 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 472 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1831  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 487 aa  270  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf132  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 470 aa  266  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 460 aa  266  8e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 488 aa  265  8e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 476 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 477 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 501 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 498 aa  262  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 463 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 475 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 460 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 460 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 468 aa  259  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 500 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 467 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 493 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 456 aa  259  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 460 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 461 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 460 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>