More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl087 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl087  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 441 aa  878    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.29436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0110  cysteinyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0240951  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 472 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 466 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf132  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0138  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 465 aa  306  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 466 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 466 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 481 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 457 aa  295  9e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 466 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 469 aa  292  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 485 aa  292  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 466 aa  289  9e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 466 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 465 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 447 aa  285  9e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 501 aa  282  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 494 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 476 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1831  cysteinyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 469 aa  280  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0215074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 456 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 456 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 488 aa  279  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 487 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 476 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 466 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 462 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 485 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 462 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 465 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 468 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 484 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 461 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 481 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 459 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 489 aa  273  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 472 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>