More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0816 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1160    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
570 aa  569  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
570 aa  547  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
588 aa  532  1e-150  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
566 aa  497  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
574 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
555 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
555 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
555 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
555 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
561 aa  419  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 
561 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
557 aa  395  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
562 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
561 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
564 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
560 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
634 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
571 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
569 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
573 aa  340  4e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
574 aa  330  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
590 aa  323  5e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
579 aa  309  6.999999999999999e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  35.83 
 
 
858 aa  207  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
565 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
781 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
565 aa  203  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
568 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
561 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
560 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
799 aa  199  7.999999999999999e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
563 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
580 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
777 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
777 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
552 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
561 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
816 aa  196  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
794 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
562 aa  196  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
565 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
561 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
552 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
778 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
569 aa  193  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
565 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
554 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
559 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
553 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
558 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
597 aa  188  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
557 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
565 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
569 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
559 aa  187  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  32.32 
 
 
749 aa  187  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
569 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
570 aa  187  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
565 aa  186  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
589 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
569 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
569 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
569 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
569 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
558 aa  183  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
564 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  30.84 
 
 
728 aa  183  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
555 aa  183  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
540 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
556 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
565 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
556 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
555 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  32.16 
 
 
628 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  32.53 
 
 
541 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
590 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
576 aa  180  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
555 aa  180  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
556 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
559 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
566 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
579 aa  178  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
564 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
555 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  28.77 
 
 
720 aa  178  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
569 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
579 aa  177  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
556 aa  177  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>