48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0668 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 75 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.11 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  40.68 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.11 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.39 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  28.57 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 77 aa  42  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 77 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.51 
 
 		 77 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  37.74 
 
 		 460 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>