137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0505 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  47.92 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  43.75 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  48.81 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  46.74 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  45.57 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  46.43 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  45.57 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  45.24 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  44.3 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  44.3 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  39.81 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  45.24 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.33 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  41.76 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  40.22 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  47.44 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 		 102 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2078  translation initiation factor Sui1  44.3 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157753  normal  0.161852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  40.85 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  41.25 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  40 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  43.59 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  38.03 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  40.24 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  40.24 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  40.24 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  44.93 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.18 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  41.18 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  39.19 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  40.58 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  36.49 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  41.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  41.18 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  39.71 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  41.18 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  41.89 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  39.71 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  39.71 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  39.71 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  36.49 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  36.99 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  38.24 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  38.24 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  38.24 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  38.24 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  38.24 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  39.71 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  38.24 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  38.24 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  33.75 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  37.7 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  40.98 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  41.07 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  32.29 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  29.87 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.71 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  36.23 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  33.78 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  33.78 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  40.35 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  29.21 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  42.62 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  32.61 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  28.57 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0917  translation initiation factor SUI1  30.3 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00387468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12868  predicted protein  33.33 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  38.03 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.71 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  35.71 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  34.29 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  39.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  41.07 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  41.07 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  41.07 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  41.07 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  37.14 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  38.46 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  38.6 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  39.29 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>